版元ドットコム

探せる、使える、本の情報

文芸 新書 社会一般 資格・試験 ビジネス スポーツ・健康 趣味・実用 ゲーム 芸能・タレント テレビ・映画化 芸術 哲学・宗教 歴史・地理 社会科学 教育 自然科学 医学 工業・工学 コンピュータ 語学・辞事典 学参 児童図書 ヤングアダルト 全集 文庫 コミック文庫 コミックス(欠番扱) コミックス(雑誌扱) コミックス(書籍) コミックス(廉価版) ムック 雑誌 増刊 別冊
バリアントデータ検索&活用 変異・多型情報を使いこなす達人レシピ 坊農 秀雅(編集) - 羊土社
..
【利用不可】

バリアントデータ検索&活用 変異・多型情報を使いこなす達人レシピ (バリアントデータケンサクアンドカツヨウヘンイタケイジョウホウヲツカイコナスタツジンレシピ)

このエントリーをはてなブックマークに追加
発行:羊土社
AB判
238ページ
定価 5,000円+税
ISBN
978-4-7581-2245-0   COPY
ISBN 13
9784758122450   COPY
ISBN 10h
4-7581-2245-8   COPY
ISBN 10
4758122458   COPY
出版者記号
7581   COPY
Cコード
C3047  
3:専門 0:単行本 47:医学・歯学・薬学
出版社在庫情報
不明
書店発売日
登録日
2020年9月1日
最終更新日
2020年9月1日
このエントリーをはてなブックマークに追加

紹介

ヒト疾患の研究には膨大なヒトゲノムデータ,特に日本人の疾患であれば日本人ゲノムデータの活用が,腕の見せどころ.共有の進む世界中の食材(データ)を,ラボで,自宅で,自在に調理(研究)するレシピをご紹介.

目次

Chapter 1 バリアントデータを検索する(世界)
(1)興味ある遺伝子の数塩基多型・構造多型を調べる ~dbSNP,dbVar
(2)興味あるゲノム領域にみられるバリアントを調べる ~gnomAD(ノマド)
[COLUMN]ヒト以外のバリアント情報の検索と比較
(3)Pathogenic なバリアントを調べる ~ClinVar
[COLUMN]OMIMとNCBI ~疾患関連のリソース
(4)アクセス制限されたデータベースから,興味あるバリアントを保有するデータを探索・利用する ~GA4GH Beacon とNBDC ヒトデータベース
(5)病名・遺伝子名・バリアントのID などから検索してGWAS の知見を活用する ~GWAS catalog
(6)症状から検索して類似の稀少・遺伝性疾患を探し,未知バリアントを評価する ~PubCaseFinder
[COLUMN]今日から使える論文執筆支援サービス

Chapter 2 バリアントデータを検索する(日本人)
(1)日本人集団におけるバリアントの頻度情報を調べる ~TogoVar1
(2)バリアントの詳細情報を調べる ~TogoVar2
(3)日本人と日本人以外の集団のバリアント頻度を比較する ~TogoVar3
[COLUMN]コンピューターインフラとResource Description Framework(RDF)
(4)個人レベルのバリアント情報を活用する ~Japanese Genotype-phenotype Archive(JGA)
[COLUMN]dbGaP,EGA
(5)多層オミクス情報と紐付いたバリアント情報を活用する ~jMorp
[COLUMN]日本人のゲノム解析には日本人基準ゲノム配列JG1を
(6)エピゲノム・遺伝子発現情報と紐付いたバリアント情報を活用する ~iMETHYL
[COLUMN]ddbj/human-reseq:再現性のあるバリアント検出ワークフローの開発

Chapter 3 がんの体細胞変異を検索する
(1)興味あるバリアントのpathogenicity,構造や治療に与える影響などを調べる ~COSMIC/COSMIC-3D,CIViC
(2)興味あるバリアントのがん種ごとの頻度の違いを調べる ~TCGAとcBioPortal
(3)興味あるがん種に特徴的なバリアントを調べる ~TCGA とGDC-DP,COSMIC

上記内容は本書刊行時のものです。