目次

総　論　　　吉森　保
　1　オートファジーとは何か
　2　オートファジー関連因子と基本メカニズム
　　1．オートファジーを駆動・制御するタンパク質
　　2．オートファゴソーム膜の起源
　3　オートファジーが関連する疾患


第Ⅰ部　オートファジー研究のこれまでの歩み
第1章　オートファジー研究の歴史（ATG以前）　　　上野　隆
　1-1　リソソームの発見からオートファジーの概念の確立まで
　1-2　プレATG時代のオートファジー研究の成果
　　1．オートファジーの飢餓誘導と非選択性
　　2．グルカゴンとインスリンによるオートファジーの調節
　　3．アミノ酸によるオートファジーの調節
　　4．培養細胞によるオートファジー研究
　　5．オートファゴソーム膜の起源を巡って

第2章　酵母が切り開いたオートファジー研究の曙　　　野田 健司
　2-1　酵母のオートファジー研究の源流
　2-2　酵母におけるオートファジーの発見
　2-3　apg変異株の単離
　2-4　APG遺伝子の同定
　2-5　ATGへの統合
　2-6　Atg間の関係性の氷解


第Ⅱ部　オートファジーの分子機構
第3章　オートファジーの誘導と抑制をつかさどる2つのキナーゼAtg1/Ulk1とTORC1　　　荒木 保弘・野田 健司
　3-1　富栄養下でオートファジーが抑制される仕組み
　　1．哺乳類TORC1のアミノ酸感知機構
　　2．出芽酵母のTORC1活性化経路
　　3．Rag-Ragulatorに依存しないTORC1活性化経路
　　4．TORC1の基質
　3-2　飢餓でオートファジーが誘導される仕組み
　　1．ATG遺伝子の発現誘導
　　2．Atg1/Ulk1キナーゼの活性化
　　3．Atg1/Ulk1キナーゼの基質

第4章　オートファゴソームの形成における膜動態のメカニズム　　　中戸川　仁
　4-1　Atgタンパク質の分子機能
　4-2　Atgタンパク質のオートファゴソーム形成部位への集積
　4-3　オートファゴソームの膜の源：小胞体のオートファゴソーム形成への関与

第5章 哺乳類細胞におけるオートファゴソーム成熟の分子機構　　　小山-本田 郁子・水島　昇
　5-1　幕開け：オートファゴソーム成熟の分子機構解明へ
　5-2　オートファゴソームの閉鎖
　5-3　オートファゴソームの輸送
　5-4　リソソームとの融合
　5-5　リソソーム酵素による分解
　　Column　オートファゴソーム内膜の分解をとらえた！ 　5-6　オートファゴソームの成熟機構に残された課題

第6章 オートファゴソームの内膜分解と分解産物の再利用に機能する分子装置　　　関藤 孝之
　6-1　オートファゴソーム内膜小胞の分解
　6-2　液胞/リソソームからの分解産物の排出・再利用
　　1．リソソームにおけるアミノ酸トランスポーターの発見
　　2．AAAPトランスポータ
　　3．Atg22
　　4．PQループタンパク質
　　5　オートファジー分解産物の再利用に関する研究の展望
　　Column　液胞を巡る研究

第7章ATG分子群の構造と機能　　　野田 展生
　7-1　Atg1/ULK複合体
　7-2　オートファジー特異的PI3K複合体
　7-3　Atg結合系

第8章　ミクロオートファジー　　　奥　公秀・阪井 康能
　8-1　ミクロオートファジー研究の流れ
　8-2　ミクロオートファジーの分子機構
　8-3　ミクロオートファジー研究の課題と展望

第9章　出芽酵母の選択的オートファジー　　　鈴木 邦律
　9-1　選択的オートファジーの足場タンパク質：Atg11
　9-2　Atg11依存的選択的オートファジー
　9-3　Atg11非依存的な選択的オートファジー

第10章　哺乳類選択的オートファジー概論　　　一村 義信・小松 雅明
　10-1　選択的オートファジー発見の歴史
　10-2　選択的オートファジーとは
　10-3　ユビキチンシグナルとコアATGタンパク質
　10-4　レセプタータンパク質
　10-5　選択的オートファジー各論
　10-6　選択的オートファジーと連動したシグナル伝達

第11章　ミトコンドリア分別・除去システムの基本原理　　　岡本 浩二
　11-1　歴史的背景と意義
　11-2　マイトファジーをどうとらえるか
　11-3　分別標識タンパク質：レセプター
　11-4　分別標識タンパク質：ユビキチン
　11-5　多細胞生物の初期発生とミトコンドリア分解
　11-6　今後の展望：未解決の根本問題と新たな可能性
　　Column　酵母が導く現象から分子理解への冒険

第12章　ゼノファジー：病原体の排除システム　　　阿部 章夫
　12-1　病原細菌とゼノファジー
　12-2　ゼノファジーによる病原細菌の選択的排除
　12-3　病原細菌におけるゼノファジーの対抗戦略
　　Column　細菌学者から見たゼノファジー


第Ⅲ部　オートファジーの生理機能
第13章　マウスでのATG の意義　　　吉井 紗織・水島　昇
　13-1　マウスにおけるオートファジーの生理的意義
　　1．胚発生
　　2．全身でオートファジー関連因子を欠損するマウスの表現型
　　3．組織特異的オートファジー不全マウスの表現型
　13-2　マウスにおけるATGのオートファジー以外のはたらき
　　1．感染・炎症制御
　　2．網膜色素上皮細胞でのレチノイドのリサイクル
　　3．破骨細胞の波状縁形成と骨吸収

第14章　植物のさまざまな局面におけるオートファジーの生理機能　　　吉本 光希
　14-1　非生物的ストレス適応
　　1．栄養素のリサイクル
　　2．高塩・乾燥・高温・低酸素ストレス適応
　14-2　植物免疫
　14-3　オルガネラ品質管理
　　1．クロロファジー
　　2．ペキソファジー
　　3．レティキュロファジー
　　4．マイトファジー

第15章　オートファジーと核酸代謝　　　川俣 朋子
　15-1　非選択的オートファジーによるRNA分解と選択的なリボソーム分解（リボファジー） 　15-2　細胞内凝集体，RNA顆粒の分解（グラニュロファジー，アグリファジー） 　15-3　核および核小体の分解（ヌクレオファジー，PMN） 　15-4　病原体の分解（ゼノファジー），ウイルス分解とミトコンドリア分解
　15-5　RNautophagy/DNautophagy
　15-6　RNaseとDNase
　15-7 RNA/DNAの分解後の運命：細胞内輸送と細胞内の核酸代謝系との接点

第16章　栄養飢餓とオートファジー　　　久万 亜紀子
　16-1　飢餓応答
　16-2　オートファジーと栄養供給
　　1．タンパク質分解
　　2．脂質分解
　　3．グリコーゲン分解
　16-3　栄養によるオートファジーの制御
　　1．ホルモン
　　2．アミノ酸
　　3．栄養応答性転写因子
　　Column　新生仔マウスのオートファジー


第Ⅳ部　オートファジーと疾患・臨床応用
第17章　パーキンソン病の分子病態とオートファジー-リソソーム系の破綻　　　佐藤 栄人・服部 信孝
　17-1　孤発性パーキンソン病とミトコンドリア研究
　17-2　遺伝性パーキンソン病の原因遺伝子とタンパク質分解異常
　17-3　遺伝性パーキンソン病とミトコンドリア品質管理の破綻
　17-4　パーキンソン病とLewy小体
　17-5　オートファジー-リソソーム系と封入体形成
　17-6　遺伝性パーキンソン病とリソソームの破綻

第18章　オートファジーと癌　　　川端　剛・吉森　保
　18-1　癌抑制遺伝子としてのオートファジー遺伝子
　18-2　癌の進行とオートファジー
　18-3　抗癌剤としてのオートファジー阻害剤
　18-4　オートファジー阻害剤の応用と問題点

第19章　オートファジーと代謝性疾患　　　藤谷 与士夫・福中 彩子
　19-1　膵β細胞におけるオートファジー
　19-2　脂肪細胞とオートファジー
　19-3　脂肪細胞のベージュ化とオートファジー
　19-4　肝細胞とオートファジー

第20章　オートファジーと老化 中村 修平・吉森　保
　20-1　寿命制御経路で共通して必要なオートファジーの活性化
　20-2　インスリン/IGF-1シグナル
　20-3　TORシグナル
　20-4　カロリー制限
　20-5　生殖腺からのシグナル：生殖細胞除去
　20-6　ミトコンドリア機能抑制
　20-7　オートファジーの誘導による抗老化と寿命延長
　20-8　寿命制御におけるオートファジー制御因子
　20-9　オートファジー活性化による抗老化と寿命延長のメカニズム

第21章　オートファジーと心疾患　　　種池　学・大津 欣也
　21-1　非ストレス下の心臓におけるオートファジー
　21-2　ストレス下の心臓におけるオートファジー
　21-3　炎症とオートファジー
　21-4　老化とオートファジー
　21-5　マイトファジー
　　Column　筆者らの研究とオートファジー

第22章　オートファジーと腎疾患　　　高橋 篤史・猪阪 善隆
　22-1　定常状態でのオートファジー
　　Column1　腎臓におけるオートファジーの歴史は古い！
　22-2　腎疾患におけるオートファジー
　　Column2　リソソームの主要制御因子TFEB
　22-3　腎臓におけるオートファジー研究の展望
　22-4　腎臓におけるシャペロン介在性オートファジー（CMA）

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外国語索引